MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİ
Genetik ve Biyomühendislik
GBE 308 | Ders Tanıtım Bilgileri
| Dersin Adı |
Kanser Biyolojisi ve Genetiği
|
|
Kodu
|
Yarıyıl
|
Teori
(saat/hafta) |
Uygulama/Lab
(saat/hafta) |
Yerel Kredi
|
AKTS
|
|
GBE 308
|
Bahar
|
2
|
2
|
3
|
5
|
| Ön-Koşul(lar) |
|
|||||||||
| Dersin Dili |
İngilizce
|
|||||||||
| Dersin Türü |
Zorunlu
|
|||||||||
| Dersin Düzeyi |
Lisans
|
|||||||||
| Dersin Veriliş Şekli | Yüz Yüze | |||||||||
| Dersin Öğretim Yöntem ve Teknikleri | TartışmaGrup çalışmasıProblem çözmeOlgu / Vaka çalışmasıSoru & CevapDeney / Laboratuvar / Atölye uygulamaAnlatım / Sunum | |||||||||
| Dersin Koordinatörü | ||||||||||
| Öğretim Eleman(lar)ı | ||||||||||
| Yardımcı(ları) | - | |||||||||
| Dersin Amacı | Bu dersin temel amacı hücrenin moleküler davranışlarını farklı gerçek senaryolar kapsamında anlatarak, kansere yol açan temel mekanizmaları ve bunları hedef alan tedavi stratejilerinin mantığını öğretmektir. Kanserin çok basamaklı oluşum sürecinin farklı hücresel mekanizmalar ve bunların kompleks ilişkileri kapsamında değerlendirdikten sonra, bunları kanser ile ilgili problemlerin araştırılması ve çözümünde literatür taraması eşliğinde deney tasarımlarıyla projelendirilmesi ve de olası olgular dahilinde sonuçların yorumlanması amaçlanmaktadır. |
| Öğrenme Çıktıları |
Bu dersi başarıyla tamamlayabilen öğrenciler;
|
| Ders Tanımı | Bu ders, diğer Genetik ve Biyomühendislik temel birinci sınıf ve ikinci sınıf derslerinde öğrenilen hücresel mekanizmaların kanser ile ilişkisini açıklayan ve kanser ile ilgili karmaşık problemleri ortaya koyan bir derstir. Kanserin genel oluşum sürecini tümör baskılayıcı ve onkogenlerdeki değişimleri, hücre döngüsüne bunların etkisini, hücre ölümü, otofaji ve hücre yaşlanması arasındaki ilişkiyi ortaya koyar. Ayrıca, DNA hasarı ve bunun moleküler onarımı, tedavisel yaklaşımlardaki önemi, sinyal yolakları arasında kompleks ilişkiler, tümör evrimi ve genomik düzensizlikler, kanser metabolizması, anjiyogenez, metastaz, kanser kök hücreleri,kanser epigenetiği ve de temel kanser immünolojisine giriş konularını kapsamaktadır. |
|
|
Temel Ders |
X
|
| Uzmanlık/Alan Dersleri | ||
| Destek Dersleri | ||
| İletişim ve Yönetim Becerileri Dersleri | ||
| Aktarılabilir Beceri Dersleri |
HAFTALIK KONULAR VE İLGİLİ ÖN HAZIRLIK ÇALIŞMALARI
| Hafta | Konular | Ön Hazırlık |
| 1 | Kansere giriş | Chapter 2. Weinberg, R.A. The Biology of Cancer (2nd ed.). W.W. Norton & Company (2013) ISBN: 9780815342199. Hanahan, Douglas, and Robert A. Weinberg. "The hallmarks of cancer." Cell 100.1 (2000): 57-70. Hanahan, Douglas, and Robert A. Weinberg. "Hallmarks of cancer: the next generation." Cell 144.5 (2011): 646-674. |
| 2 | Çoklu tümörleşme basamakları | Chapter 11. Weinberg, R.A. The Biology of Cancer (2nd ed.). W.W. Norton & Company (2013) ISBN: 9780815342199. |
| 3 | Hücre döngüsü mekanizmaları | Chapter 8. Weinberg, R.A. The Biology of Cancer (2nd ed.). W.W. Norton & Company (2013) ISBN: 9780815342199. |
| 4 | Hücresel Onkogenler | Chapter 8. Weinberg, R.A. The Biology of Cancer (2nd ed.). W.W. Norton & Company (2013) ISBN: 9780815342199. |
| 5 | Hücre ölümü ve otofaji | Chapter 9. Weinberg, R.A. The Biology of Cancer (2nd ed.). W.W. Norton & Company (2013) ISBN: 9780815342199. Elmore, Susan. "Apoptosis: a review of programmed cell death." Toxicologic pathology 35.4 (2007): 495-516. Glick, Danielle, Sandra Barth, and Kay F. Macleod. "Autophagy: cellular and molecular mechanisms." The Journal of pathology 221.1 (2010): 3-12. Nikoletopoulou, Vassiliki, et al. "Crosstalk between apoptosis, necrosis and autophagy." Biochimica et Biophysica Acta (BBA)-Molecular Cell Research 1833.12 (2013): 3448-3459. Ichim, Gabriel, and Stephen WG Tait. "A fate worse than death: apoptosis as an oncogenic process." Nature Reviews Cancer 16.8 (2016): 539-548. |
| 6 | Hücre ölümü ve otofaji | Chapter 9. Weinberg, R.A. The Biology of Cancer (2nd ed.). W.W. Norton & Company (2013) ISBN: 9780815342199. Elmore, Susan. "Apoptosis: a review of programmed cell death." Toxicologic pathology 35.4 (2007): 495-516. Glick, Danielle, Sandra Barth, and Kay F. Macleod. "Autophagy: cellular and molecular mechanisms." The Journal of pathology 221.1 (2010): 3-12. Nikoletopoulou, Vassiliki, et al. "Crosstalk between apoptosis, necrosis and autophagy." Biochimica et Biophysica Acta (BBA)-Molecular Cell Research 1833.12 (2013): 3448-3459. Ichim, Gabriel, and Stephen WG Tait. "A fate worse than death: apoptosis as an oncogenic process." Nature Reviews Cancer 16.8 (2016): 539-548. |
| 7 | Kanserde DNA hasarı onarımı ve kemoterapi | Chapter 12 & Chapter 16. Weinberg, R.A. The Biology of Cancer (2nd ed.). W.W. Norton & Company (2013) ISBN: 9780815342199. Basu, Ashis K. "DNA damage, mutagenesis and cancer." International journal of molecular sciences 19.4 (2018): 970. Curtin, Nicola J. "DNA repair dysregulation from cancer driver to therapeutic target." Nature Reviews Cancer 12.12 (2012): 801-817. Roos, Wynand P., Adam D. Thomas, and Bernd Kaina. "DNA damage and the balance between survival and death in cancer biology." Nature Reviews Cancer 16.1 (2016): 20-33. Helleday, Thomas, et al. "DNA repair pathways as targets for cancer therapy." Nature Reviews Cancer 8.3 (2008): 193-204. |
| 8 | Arasınav | - |
| 9 | Hücresel yaşlanma ve kanser ilişkisi | Chapter 10. Weinberg, R.A. The Biology of Cancer (2nd ed.). W.W. Norton & Company (2013) ISBN: 9780815342199. Campisi, Judith. "Aging, cellular senescence, and cancer." Annual review of physiology 75 (2013): 685-705. Herranz, Nicolás, and Jesús Gil. "Mechanisms and functions of cellular senescence." The Journal of clinical investigation 128.4 (2018): 1238-1246. |
| 10 | Kanserde sinyal iletimi ve kanser araştırmaları tasarımı | Chapter 5 & 6. Weinberg, R.A. The Biology of Cancer (2nd ed.). W.W. Norton & Company (2013) ISBN: 9780815342199. Lemmon, Mark A., and Joseph Schlessinger. "Cell signaling by receptor tyrosine kinases." Cell 141.7 (2010): 1117-1134. Manning, Brendan D., and Alex Toker. "AKT/PKB signaling: navigating the network." Cell 169.3 (2017): 381-405. Han, Fei, et al. "The critical role of AMPK in driving Akt activation under stress, tumorigenesis and drug resistance." Nature communications 9.1 (2018): 1-16. |
| 11 | Kanserde genomik düzensizlik ve rezistans gelişimi | Negrini, Simona, Vassilis G. Gorgoulis, and Thanos D. Halazonetis. "Genomic instability—an evolving hallmark of cancer." Nature reviews Molecular cell biology 11.3 (2010): 220-228. Holohan, Caitriona, et al. "Cancer drug resistance: an evolving paradigm." Nature Reviews Cancer 13.10 (2013): 714-726. |
| 12 | Kanser metabolizması, hipoksi ve anjiyogenez | Chapter 13. Weinberg, R.A. The Biology of Cancer (2nd ed.). W.W. Norton & Company (2013) ISBN: 9780815342199. Vazquez, Alexei, et al. "Cancer metabolism at a glance." Journal of cell science 129.18 (2016): 3367-3373. Muz, Barbara, et al. "The role of hypoxia in cancer progression, angiogenesis, metastasis, and resistance to therapy." Hypoxia 3 (2015): 83. Weis, Sara M., and David A. Cheresh. "Tumor angiogenesis: molecular pathways and therapeutic targets." Nature medicine 17.11 (2011): 1359-1370. |
| 13 | Tümör evrimi ve epigenetik | Chapter 11. Weinberg, R.A. The Biology of Cancer (2nd ed.). W.W. Norton & Company (2013) ISBN: 9780815342199. Dawson, Mark A., and Tony Kouzarides. "Cancer epigenetics: from mechanism to therapy." cell 150.1 (2012): 12-27. Nassar, Dany, and Cédric Blanpain. "Cancer stem cells: basic concepts and therapeutic implications." Annual Review of Pathology: Mechanisms of Disease 11 (2016): 47-76. McGranahan, Nicholas, and Charles Swanton. "Clonal heterogeneity and tumor evolution: past, present, and the future." Cell 168.4 (2017): 613-628. Ciriello, Giovanni, et al. "Emerging landscape of oncogenic signatures across human cancers." Nature genetics 45.10 (2013): 1127-1133. |
| 14 | Kanserde metastaz, bağışıklık yanıtı ve immunoterapi | Chapter 14. Weinberg, R.A. The Biology of Cancer (2nd ed.). W.W. Norton & Company (2013) ISBN: 9780815342199. Riggi, Nicolo, Michel Aguet, and Ivan Stamenkovic. "Cancer metastasis: a reappraisal of its underlying mechanisms and their relevance to treatment." Annual Review of Pathology: Mechanisms of Disease 13 (2018): 117-140. Galluzzi, Lorenzo, et al. "Immunogenic cell death in cancer and infectious disease." Nature Reviews Immunology 17.2 (2017): 97-111. |
| 15 | Dersin gözden geçirilmesi | |
| 16 | Final Sınavı |
| Ders Kitabı | The Biology of Cancer (2nd ed.). W.W. Norton & Company (2013) ISBN: 9780815342199. |
| Önerilen Okumalar/Materyaller |
|
DEĞERLENDİRME ÖLÇÜTLERİ
| Yarıyıl Aktiviteleri | Sayı | Katkı Payı % |
| Katılım | ||
| Laboratuvar / Uygulama | ||
| Arazi Çalışması | ||
| Küçük Sınav / Stüdyo Kritiği | ||
| Portfolyo | ||
| Ödev | ||
| Sunum / Jüri Önünde Sunum | ||
| Proje |
1
|
35
|
| Seminer/Çalıştay | ||
| Sözlü Sınav | ||
| Ara Sınav |
1
|
30
|
| Final Sınavı |
1
|
35
|
| Toplam |
| Yarıyıl İçi Çalışmalarının Başarı Notuna Katkısı |
2
|
65
|
| Yarıyıl Sonu Çalışmalarının Başarı Notuna Katkısı |
1
|
35
|
| Toplam |
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
| Yarıyıl Aktiviteleri | Sayı | Süre (Saat) | İş Yükü |
|---|---|---|---|
| Teorik Ders Saati (Sınav haftası dahildir: 16 x teorik ders saati) |
16
|
2
|
32
|
| Laboratuvar / Uygulama Ders Saati (Sınav haftası dahildir. 16 x uygulama/lab ders saati) |
16
|
2
|
32
|
| Sınıf Dışı Ders Çalışması |
14
|
1
|
14
|
| Arazi Çalışması |
0
|
||
| Küçük Sınav / Stüdyo Kritiği |
0
|
||
| Portfolyo |
0
|
||
| Ödev |
0
|
||
| Sunum / Jüri Önünde Sunum |
0
|
||
| Proje |
1
|
37
|
37
|
| Seminer/Çalıştay |
0
|
||
| Sözlü Sınav |
0
|
||
| Ara Sınavlar |
1
|
15
|
15
|
| Final Sınavı |
1
|
20
|
20
|
| Toplam |
150
|
DERSİN ÖĞRENME ÇIKTILARININ PROGRAM YETERLİLİKLERİ İLE İLİŞKİSİ
|
#
|
Program Yeterlilikleri / Çıktıları |
* Katkı Düzeyi
|
||||
|
1
|
2
|
3
|
4
|
5
|
||
| 1 | Matematik, Fen Bilimleri ve Genetik ve Biyomühendislik konularında yeterli bilgi sahibidir; bu alanlardaki kuramsal ve uygulamalı bilgileri, karmaşık mühendislik problemlerinde kullanır. |
|||||
| 2 | Karmaşık Genetik ve Biyomühendislik problemlerini saptar, tanımlar, formüle eder ve çözer; bu amaca uygun analiz ve modelleme yöntemlerini seçer ve uygular. |
X | ||||
| 3 | Karmaşık bir sistemi, süreci, cihazı veya ürünü gerçekçi kısıtlar ve koşullar altında, belirli gereksinimleri karşılayacak şekilde tasarlar; bu amaçla modern tasarım yöntemlerini uygular. |
|||||
| 4 | Genetik ve Biyomühendislik uygulamalarında karşılaşılan karmaşık problemlerin analizi ve çözümü için gerekli olan modern teknik ve araçları geliştirir, seçer ve kullanır; bilişim teknolojilerini etkin bir şekilde kullanır. |
|||||
| 5 | Genetik ve Biyomühendislik araştırma konularının incelenmesi için deney tasarlar, deney yapar, veri toplar, sonuçları analiz eder ve yorumlar. |
X | ||||
| 6 | Genetik ve Biyomühendislik disiplini içinde ve çok disiplinli takımlarda etkin biçimde çalışır; bireysel çalışma sergiler. |
X | ||||
| 7 | Türkçe sözlü ve yazılı etkin iletişim kurar; etkin rapor yazar ve yazılı raporları anlar, tasarım ve üretim raporları hazırlar, etkin sunum yapar, açık ve anlaşılır talimat verir ve alır. |
|||||
| 8 | Genetik ve Biyomühendislik uygulamalarının evrensel ve toplumsal boyutlarda sağlık, çevre ve güvenlik üzerindeki etkileri ve çağın sorunları hakkında bilgi sahibidir; Genetik ve Biyomühendislik çözümlerinin hukuksal sonuçlarının farkındadır. |
|||||
| 9 | Etik ilkelerine uygun davranma, mesleki ve etik sorumluluk bilincine sahiptir; Genetik ve Biyomühendislik uygulamalarında kullanılan standartlar hakkında bilgi sahibidir. |
|||||
| 10 | Proje yönetimi, risk yönetimi ve değişiklik yönetimi gibi, iş hayatındaki uygulamalar hakkında bilgi sahibidir; girişimcilik, yenilikçilik hakkında bilinçlidir; sürdürülebilir kalkınma hakkında bilgi sahibidir. |
|||||
| 11 | Bir yabancı dili kullanarak Genetik ve Biyomühendislik ile ilişkili konularda, bilgi toplar ve meslektaşları ile iletişim kurar. |
|||||
| 12 | İkinci yabancı dili orta düzeyde kullanır. |
|||||
| 13 | Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilincindedir; bilgiye erişir, bilim ve teknolojideki gelişmeleri izler ve kendini sürekli yeniler; insanlık tarihi boyunca oluşan bilgi birikimini Genetik ve Biyomühendislik alanıyla ilişkilendirir. |
|||||
*1 Lowest, 2 Low, 3 Average, 4 High, 5 Highest
HABER |TÜM HABERLER
‘Genetiğinde’ Başarı Var
İzmir Ekonomi Üniversitesi (İEÜ) Genetik ve Biyomühendislik Bölümü’nden bu yıl mezun olan Ezgi Kaya, Almanya’nın Münih şehrindeki dünyaca ünlü Ludwig Maximilian Üniversitesi’ne
Genetikçilerin ‘Almanya’ başarısı
İzmir Ekonomi Üniversitesi (İEÜ) Genetik ve Biyomühendislik Bölümü’nden yeni mezun olan 9 öğrenci, yüksek lisans için Almanya’daki 6 farklı üniversiteden kabul alarak
Lisans Öğrencilerimizin Sanayi Ortaklı TÜBİTAK Projesi Kabul Edildi
Genetik ve Biyomühendislik bölümü 4. Sınıf öğrencilerimizden Alara Aysu Çandarlı’nın yürütücüsü ve Mert Ali Çalışkan’ın araştırmacı olduğu, Dr. Öğr. Üyesi Işınay E.
Lisans Öğrencilerimizin Proje Başarısı
Danışmanlığını bölümümüz öğretim üyelerinin yaptığı projeler ile lisans öğrencilerimiz, 2209-A TÜBİTAK BİDEB Üniversite Öğrencileri Araştırma Projeleri Destekleme Programı kapsamında desteklenmeye hak kazanmıştır. Ayrıntıları aşağıda
Gençlerden ‘sürdürülebilir enerji’ fikirleri
İzmir Ekonomi Üniversitesi (İEÜ), sanayiden ulaşıma kadar pek çok alanda kullanılan, karbon salınımına yol açmadığı için çevreci özelliğiyle ön plana çıkan biyohidrojenle
Kaplıcada keşif
İzmir Ekonomi Üniversitesi (İEÜ) Genetik ve Biyomühendislik Bölümü’nden Dr. Öğretim Üyesi Mine Güngörmüşler ve iki yüksek lisans öğrencisi, İzmir’de bulunan 5 kaplıcadaki
Dünyadaki 7 kişi arasına girdi
İzmir Ekonomi Üniversitesi (İEÜ) Genetik ve Biyomühendislik Bölümü’nden bu yıl mezun olan Arda Kıpçak, Amerika Birleşik Devletleri’ndeki (ABD) dünyaca ünlü Virginia Üniversitesi’ne
Virüse karşı ‘akıllı kabin’
İzmir Ekonomi Üniversitesi’nden (İEÜ) Doç. Dr. Osman Doluca ve 4 öğrencisi, Kovid-19 virüsünün tespiti için vakalardan alınan numunelerin, teste gönderilmeden önce steril