GBE 407 | Ders Tanıtım Bilgileri - Genetik ve Biyomühendislik

Dersin Adı

Genomik ve Proteomik

Kodu	Yarıyıl	Teori (saat/hafta)	Uygulama/Lab (saat/hafta)	Yerel Kredi	AKTS
GBE 407	Güz/Bahar	2	2	3	6

Ön-Koşul(lar)	Yok
Dersin Dili	İngilizce
Dersin Türü	Seçmeli
Dersin Düzeyi	Lisans
Dersin Veriliş Şekli	-
Dersin Öğretim Yöntem ve Teknikleri	Tartışma Grup çalışması Soru & Cevap Anlatım / Sunum
Ulusal Meslek Sınıflandırma Kodu	-
Dersin Koordinatörü	Doç. Dr. Osman DOLUCA
Öğretim Eleman(lar)ı	Doç. Dr. Osman DOLUCA
Yardımcı(ları)	-

Dersin Amacı

Bu dersin amacı protein biyokimyası, biyoinformatik ve işlevsel genomikte kullanılan yöntemleri tanıtmaktır. Bu ders kapsamında, ökaryotik organizmaların biyotik ve abiyotik stres yanıtları tüm genom seviyelerinde analiz edilecek ve kişiselleştirilmiş ilaç uygulamalarının önemi tartışılacaktır.

Öğrenme Çıktıları

#	İçerik	PÇ Sub	* Katkı Düzeyi
#	İçerik	PÇ Sub	1	2	3	4	5
1	Çeşitli türlerin genomik yapılarını belirleyebilecek,
2	Geleneksel ve modern genomik teknikleri açıklayabilecek,
3	Karşılaştırmalı genomik uygulamaları uygulayabilecek,
4	Protein yapı ve işlevinin soruşturulmasında kullanılan proteomik yaklaşımları kullanabilecek,
5	Genomik ve proteomik uygulama alanlarını tartışabilecektir.

Ders Tanımı

Genomik ve proteomik yaklaşımların tanımı ve uygulama alanları, yapısal genomik, işlevsel genomik ve karşılaştırmalı genomiğin kullanımı, canlıların genomlarının analizi, proteomik analizler. Rekombinant DNA yöntemleri, genetiği değiştirilmiş bitkiler ve hayvanlar ile kullanımları tanıtılacaktır.

Dersin Kategorisi	Temel Ders
	Uzmanlık/Alan Dersleri	X
	Destek Dersleri
	İletişim ve Yönetim Becerileri Dersleri
	Aktarılabilir Beceri Dersleri

Hafta	Konular	Ön Hazırlık	Öğrenme Çıktısı
1	Genomik’e Giriş	Concepts and Techniques in Genomics and Proteomics, Nachimuthu Saraswathy, Ponnusamy Ramalingam, Elsevier, 2011, 978-1-907568-10-7. Chapter 1
2	İnsan Genom Projesi	Concepts and Techniques in Genomics and Proteomics, Nachimuthu Saraswathy, Ponnusamy Ramalingam, Elsevier, 2011, 978-1-907568-10-7. Chapter 2
3	Model Organizmaların ve Vektörlerin Genomları	Concepts and Techniques in Genomics and Proteomics, Nachimuthu Saraswathy, Ponnusamy Ramalingam, Elsevier, 2011, 978-1-907568-10-7. Chapter 3,4
4	DNA ve Genom Sekanslama Yöntemleri	Concepts and Techniques in Genomics and Proteomics, Nachimuthu Saraswathy, Ponnusamy Ramalingam, Elsevier, 2011, 978-1-907568-10-7. Chapter 5,7
5	Genom Haritalama	Concepts and Techniques in Genomics and Proteomics, Nachimuthu Saraswathy, Ponnusamy Ramalingam, Elsevier, 2011, 978-1-907568-10-7. Chapter 6
6	Genom Derleme ve Açımlama	Concepts and Techniques in Genomics and Proteomics, Nachimuthu Saraswathy, Ponnusamy Ramalingam, Elsevier, 2011, 978-1-907568-10-7. Chapter 8
7	Fonksiyonel Genomik	Concepts and Techniques in Genomics and Proteomics, Nachimuthu Saraswathy, Ponnusamy Ramalingam, Elsevier, 2011, 978-1-907568-10-7. Chapter 9
8	1. Ara Sınav
9	Proteomik'e Giriş	Concepts and Techniques in Genomics and Proteomics, Nachimuthu Saraswathy, Ponnusamy Ramalingam, Elsevier, 2011, 978-1-907568-10-7. Chapter 10
10	2D Jel Elektroforez	Concepts and Techniques in Genomics and Proteomics, Nachimuthu Saraswathy, Ponnusamy Ramalingam, Elsevier, 2011, 978-1-907568-10-7. Chapter 11
11	2. Ara Sınav
12	Kütle Spektroskopisi	Concepts and Techniques in Genomics and Proteomics, Nachimuthu Saraswathy, Ponnusamy Ramalingam, Elsevier, 2011, 978-1-907568-10-7. Chapter 12
13	Peptit kütle parmak izi ile protein tanılama	Concepts and Techniques in Genomics and Proteomics, Nachimuthu Saraswathy, Ponnusamy Ramalingam, Elsevier, 2011, 978-1-907568-10-7. Chapter 13
14	Protein sekanslama teknikleri	Concepts and Techniques in Genomics and Proteomics, Nachimuthu Saraswathy, Ponnusamy Ramalingam, Elsevier, 2011, 978-1-907568-10-7. Chapter 14
15	Genel tekrar
16	Final sınavı

Ders Kitabı

Concepts and Techniques in Genomics and Proteomics, Nachimuthu Saraswathy, Ponnusamy Ramalingam, Elsevier, 2011, 978-1-907568-10-7

Önerilen Okumalar/Materyaller

Yarıyıl Aktiviteleri	Sayı	Katkı Payı %	LO 1	LO 2	LO 3	LO 4	LO 5
Katılım
Laboratuvar / Uygulama
Arazi Çalışması
Küçük Sınav / Stüdyo Kritiği	1	15
Portfolyo
Ödev	1	15
Sunum / Jüri Önünde Sunum
Proje
Seminer/Çalıştay
Sözlü Sınav
Ara Sınav	1	30
Final Sınavı	1	40
Toplam

Yarıyıl İçi Çalışmalarının Başarı Notuna Katkısı	3	60
Yarıyıl Sonu Çalışmalarının Başarı Notuna Katkısı	1	40
Toplam

Yarıyıl Aktiviteleri	Sayı	Süre (Saat)	İş Yükü
Teorik Ders Saati (Sınav haftası dahildir: 16 x teorik ders saati)	16	2	32
Laboratuvar / Uygulama Ders Saati (Sınav haftası dahildir. 16 x uygulama/lab ders saati)	16	2	32
Sınıf Dışı Ders Çalışması	14	2	28
Arazi Çalışması			0
Küçük Sınav / Stüdyo Kritiği	1	20	20
Portfolyo			0
Ödev			0
Sunum / Jüri Önünde Sunum			0
Proje	1	24	24
Seminer/Çalıştay			0
Sözlü Sınav			0
Ara Sınavlar	1	22	22
Final Sınavı	1	22	22
		Toplam	180

#	PÇ Sub	Program Yeterlilikleri / Çıktıları	* Katkı Düzeyi
#	PÇ Sub	Program Yeterlilikleri / Çıktıları	1	2	3	4	5
1	Matematik, Fen Bilimleri ve Genetik ve Biyomühendislik konularında yeterli bilgi sahibidir; bu alanlardaki kuramsal ve uygulamalı bilgileri, karmaşık mühendislik problemlerinde kullanır.		-	-	-	-	-
2	Karmaşık Genetik ve Biyomühendislik problemlerini saptar, tanımlar, formüle eder ve çözer; bu amaca uygun analiz ve modelleme yöntemlerini seçer ve uygular.		-	-	X	-	-
3	Karmaşık bir sistemi, süreci, cihazı veya ürünü gerçekçi kısıtlar ve koşullar altında, belirli gereksinimleri karşılayacak şekilde tasarlar; bu amaçla modern tasarım yöntemlerini uygular.		-	-	-	-	-
4	Genetik ve Biyomühendislik uygulamalarında karşılaşılan karmaşık problemlerin analizi ve çözümü için gerekli olan modern teknik ve araçları geliştirir, seçer ve kullanır; bilişim teknolojilerini etkin bir şekilde kullanır.		-	-	X	-	-
5	Genetik ve Biyomühendislik araştırma konularının incelenmesi için deney tasarlar, deney yapar, veri toplar, sonuçları analiz eder ve yorumlar.		-	-	-	-	-
6	Genetik ve Biyomühendislik disiplini içinde ve çok disiplinli takımlarda etkin biçimde çalışır; bireysel çalışma sergiler.		-	-	X	-	-
7	Türkçe sözlü ve yazılı etkin iletişim kurar; etkin rapor yazar ve yazılı raporları anlar, tasarım ve üretim raporları hazırlar, etkin sunum yapar, açık ve anlaşılır talimat verir ve alır.		-	-	-	-	-
8	Genetik ve Biyomühendislik uygulamalarının evrensel ve toplumsal boyutlarda sağlık, çevre ve güvenlik üzerindeki etkileri ve çağın sorunları hakkında bilgi sahibidir; Genetik ve Biyomühendislik çözümlerinin hukuksal sonuçlarının farkındadır.		-	-	-	-	-
9	Etik ilkelerine uygun davranma, mesleki ve etik sorumluluk bilincine sahiptir; Genetik ve Biyomühendislik uygulamalarında kullanılan standartlar hakkında bilgi sahibidir.		-	-	-	-	-
10	Proje yönetimi, risk yönetimi ve değişiklik yönetimi gibi, iş hayatındaki uygulamalar hakkında bilgi sahibidir; girişimcilik, yenilikçilik hakkında bilinçlidir; sürdürülebilir kalkınma hakkında bilgi sahibidir.		-	-	-	-	-
11	Bir yabancı dili kullanarak Genetik ve Biyomühendislik ile ilişkili konularda, bilgi toplar ve meslektaşları ile iletişim kurar.		-	-	-	-	-
12	İkinci yabancı dili orta düzeyde kullanır.		-	-	-	-	-
13	Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilincindedir; bilgiye erişir, bilim ve teknolojideki gelişmeleri izler ve kendini sürekli yeniler; insanlık tarihi boyunca oluşan bilgi birikimini Genetik ve Biyomühendislik alanıyla ilişkilendirir.		-	-	-	-	-